Tarikat içerisinde Muaviye üzerinden bir tartışma yaşandığı ve Muhammed Saki Elhüseyni'nin Serhendi Vakfı'nı, Muaviye aleyhtarı konuşmalardan duyduğu rahatsızlık nedeniyle kurduğu öne sürülmüştü. 

Seyyid Şeyh Abdülbaki Elhüseyni’nin halifesi olarak görülen büyük oğlu Muhammed Saki Elhüseyni, iki kardeşinin de şeyhliğini ilan etmesinin ardından cemaatin bölündüğünü açıkladı.

Muhammed Saki Elhüseyni:

“Sevgili kardeşlerimiz, Serhendi Vakfı olarak aşağıdaki sivil toplum kuruluşlarıyla hiçbir bağımız kalmamıştır:

- Semerkand Vakfı,

- Tümsiad,

- Beşir Derneği,

- Gençkon.”